داستان فیلم سینمایی گردباد : آمریکایی ها زباله های اتمی را که دریکی از روستاهای خراسان مدفون شده است منفجر می کنند. در نتیجه تشعشع رادیو اکتیو ناشی از انفجار چوپان جوانی به بیماری مرموزی مبتلا می شود و گوسفندانش نیز می میرند. اهالی روستا عبدالله برادر چوپان، و همسر برادرش ، را از ترس ابتلاء به همان بیماری وادار به ترک روستا می کنند. عبدالله به پایتخت می رود و به کمک یکی از همولایتی های خود برادرش را به بیمارستان می برد. پزشکی مبارز، که ماجرا را دریافته، موضوع را به رییس بیمارستان گزارش می کند. سازمان امنیت و امریکایی ها، که در رأس شان «جاو یش» قرار دارد، که از درز کردن موضوع بیمناکند تصمیم می گیرند چوپان بیمار را به خارج منتقل کنند یا از بین ببرند. پزشک مبارز از ماجرا باخبر می شود و به کمک عبدالله و همولایتی او بیمار را از بیمارستان می ربایند و درمان می کنند. ماموران سازمان امنیت در تعقیب آنان همولایتی عبدالله و برادرش را به قتل می رسانند. عبدالله، که به خشم آمده ،بر سر راه جاو یش، رییس گروه امریکایی، کمین می کند و شیشه اتومبیل او را با ضربه چماق می شکند.